Despues intentaron llegar puntuales y cuando ivan en camino se les atravesó un problema y tuvieron que resorverlo y mientras lo resolvian Lothor, junto con su ejercito del mal atacaron la escuela y llevándose a los ninjas a su nave.
Shane, Tori y Dustin al llegar a la academia se dan cuenta de que fue totalmente absorbida dejándola sólo en escombros. Cuando van a investigar que sucedió, Lothor, desde la nave espacial los empiezan a atacar, afortunadamente encuentran a Cam, el hijo del Sensei, quien los guía a una fortaleza secreta donde se encuentran a salvo, en ese instante aparece el Sensei convertido en un Hamster por un choque entre poderes que hubo entre el sensei y lothor y le ordena a Cam entregarles los Morphers a cada uno de los tres jóvenes. Al enterarse de sus resposabilidades, no toman el hecho de ser Power Rangers en serio, pero al ver la maldad de Lothor deciden actuar con valentía.
Rangers:
- Shane Clarke Red Wind Ranger Aire Líder Wind Ninja
- Tori Hanson Blue Wind Ranger Agua
- Waldo Dustin Brooks Yellow Wind Ranger Tierra
- Hunter Bradley Crimson Thunder Ranger Trueno Líder Thunder Ninja
- Blake Bradley Navy Thunder Ranger Trueno
- Cameron "Cam" Watanabe Green Samurai Ranger Samurai Ranger y Aliado
Villano:
Lothor: El general malvado, una vez Kiya Watanabe, el hermano del Sensei Watanabe. Fue desterrado de la tierra por el uso de magia oscura, por lo que quiere vengarse de los Ninjas. Es arrojado al abismo del Mal en la batalla final. (Protagonizado por Grant McFarland)
Zords:
Hurricane MegazordCombinación de los 3 Megazords
Thunder Storm Megazord Combinación del Storm Megazord y el Thunder Megazord
Storm Megazord Combinación de los 3 Ninjazords originales
Hawk Zord (Shane/Red Ranger)
Dolphin Zord (Tori/Blue Ranger)
Lion Zord (Dustin/Yellow Ranger)
Thunder Megazord (Combinación del Insecti Zord y el Beetle Zord)
Insecti Zord (Hunter/Crimson Ranger)
Beetle Zord (Blake/Navy Ranger)
Samurai Star Megazord Transformación del Samurai Star a Megazord
Samurai Star (Cam/Green Ranger)
Mighty Mammoth Zord (Cam/Green Ranger)